Después de que aparentemente el Líder X es destruido para siempre al final de Gatchaman II, un fragmento de él que sobrevivió crece y muta en Z. Con el jefe de la familia Egobossler, el Conde Egobossler (y sus dos subordinados Mechandol y Kempler), Z está empeñado en destruyendo la Tierra y el equipo Science Ninja, una vez más. Tras la muerte de Anderson, Dr.Nambu se ha convertido en el nuevo jefe de la ISO, mientras que el equipo ahora está confinado al Gallatown (también conocido como "G-Town") bajo el agua base. Se presenta al ingeniero Kamo, y después de que New GodPhoenix es destruido desde el principio, el equipo recibe al nuevo Gatchaspartan como su mecha. El Gatchaspartan también tiene un modo especial, llamado Hypershoot, que solo puede ser utilizado por Ken (con su nueva espada "Gatchafencer"). A medida que avanza la serie, se descubre que la exposición a la radiación por el uso constante del Hypershoot está matando lentamente Ken, y ese uso continuo significaría la muerte. Mientras tanto, Z planea destruir la tierra con un asteroide antimateria, con el nombre en código "Poison Apple".
Columbia Yurikago Kai, Isao Sasaki
Columbia Yurikago-kai
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