Jin Kunugi  

, 功刀 仁

El coronel Kunugi es el comandante de TERRA. Es un hombre perseguido por su pasado; Durante la Primera Guerra Mu fue directamente responsable de la muerte de sus hijas. Su esposa se divorció de él. Kunugi es extraordinariamente amigable con sus subordinados y tolerante con Ayato; Es amigo de muchas personas influyentes en el proyecto RahXephon, incluido el profesor. También ve a Quon como una especie de hija sustituta. Aún así, sus acciones pasadas lo incitan a buscar la redención y no quiere repetir sus errores.