Es el primer ser humano nacido y criado en Ismo. Mientras vivía en el pueblo, fue el creador de problemas estrella del grupo. Fue respetado entre sus compañeros como el líder y no puso fin a las travesuras (para buenas o malas intenciones). Después de encontrarse con Susanoo y usar los poderes destructivos del mech para derrotar a sus enemigos que atacan la aldea, los aldeanos desterraron al mech y lo culpan por su desgracia. Yamato no puede lidiar con la naturaleza supersticiosa de los aldeanos y optó por irse con su mejor amigo para ver el mundo. Fue su viaje no largo lo que le permitió conocer a Oto y nuevos amigos y enemigos. Después de derrotar a Orochi, deja a Susanoo donde una vez descansó en las cuevas y lo visita para hablar. Como no hay epílogo, se supone que Yamato seguirá causando problemas en la aldea como solía hacerlo. El infierno probablemente también termine con Oto y comience una vida juntos en el pueblo. En After War, Yamato es llamado nuevamente para pilotar a Susanoo cuando una pieza del Dark Sky Carriage cae cerca de la aldea y Shuranoo se revela. Pero cuando Yamato se niega a luchar contra Shuranoo, que está poseído por Mikazuchi, Shuranoo ataca sin piedad a Susanoo y luego lo envía al lago donde es rescatado y curado por el Dragon Carrier. El renovado Susanoo vuela para encontrar a Oto que había sido secuestrado por Shuranoo. Al final, Yamato se sacrificaría a sí mismo y a Oto (voluntariamente) para derrotar a Tsukiyomi volando hacia el sol. Antes de llegar al punto de fusión, Mikazuchi aparece y les dice que él piloteará a Susanoo y que Yamato y Oto deberían vivir sus vidas. Las lágrimas caen de los ojos de Yamatos cuando Susanoo lo mira una vez más antes de volar hacia el sol destruyéndose a sí mismo y a Tsukiyomi.