Minashiro Soushi es básicamente el único de los niños en la isla Tatsumiya que sabe la verdad: el mundo ha sido invadido por una raza alienígena llamada Festum durante las últimas tres décadas y Japón fue destruido hace 28 años. Él es el hijo de Minashiro Kouzou, el comandante de la fortaleza militar secreta Alvis, que está escondida en las entrañas de la apacible isla de Tatsumiya. Desde muy joven, Soushi fue criado para convertirse en el próximo comandante de Alvis, por lo que tuvo una infancia muy aislada llevando el pesado secreto de la guerra y le dijeron día tras día que debía vivir solo para proteger la isla. Aunque era muy amigo de Kazuki cuando era niño, debido a un incidente en el que Kazuki terminó cegando el ojo izquierdo de Soushis, se han separado, pero se encuentran una vez más abrazados para apoyarse cuando el Festum ataca a Tatsumiya y es hasta ellos dos para defenderlo. Debido a su visión incompleta, Soushi no puede pilotear un Fafner y luchar contra el Festum mano a mano. En cambio, actúa como el comandante de batalla que se conecta directamente a las mentes de todos los pilotos de Fafner a través de una súper computadora llamada Sistema Siegfried, y los dirige en la batalla. Todos los pilotos, especialmente Kazuki, se aferran a él por su fuerza y liderazgo, una carga que soporta con gracia y estoicismo. Debido a sus años de aislamiento virtual, es bastante incómodo socialmente (de hecho, la mayoría de las personas lo encuentran bastante inaccesible o erróneamente piensan que es despiadado). Kazuki solo parece hacer esfuerzos para entenderlo y hacerse amigo de él y los dos se vuelven muy cercanos en el transcurso de la serie. Soushi también tiene una hermana pequeña llamada Tsubaki, que es el núcleo de las islas y alimenta todos los sistemas informáticos.