Shiki es el personaje principal de la serie Tsukihime. Él es un estudiante de segundo año amable, honesto, si no un poco juguetón. Es anémico y es propenso a desmayarse, pero hace todo lo posible para vivir una vida normal. Tiene la Percepción de los Ojos Místicos de la Muerte (Chokushi no Magan), lo que le permite ver las "Líneas" y los "Puntos" que le permiten matar todas las cosas utilizando las técnicas de asesinato altamente efectivas ocultas en su subconsciente. A pesar de estar constantemente rodeado de muerte, él aprecia más la vida que la mayoría de las personas y nunca tomaría una vida humana. Adquirió la percepción Mystic Eyes of Death durante la infancia mientras estaba en el hospital, después de recuperarse de un incidente cercano a la muerte. Él escapa de su habitación para huir a los campos cercanos, y es allí donde conoce al Magus Aozaki Aoko, a quien Shiki ahora se refiere como Sensei. Finalmente le dieron sus gafas de firma para sellar el poder en sus ojos como un regalo de despedida, junto con inolvidables lecciones de vida. Después de salir del hospital, vivió con la familia Arima durante 8 años, antes de que su hermana Akiha lo llamara a la Mansión Toono; después de que su padre falleció y ella se convirtió en la cabeza de la familia Toono. El día que debía regresar a la Mansión, mientras salía temprano de la escuela, se da cuenta, acecha y "mata" al vampiro Arcueid Brunestud en un ataque de locura. Se desmaya por el shock y se despierta en la mansión Toono más tarde esa noche, sin nada fuera de lo común. Él pasa el incidente como un sueño, es decir, hasta que lo saluda casualmente el Arcueid supuestamente muerto en su camino a la escuela al día siguiente. Es entonces, que su vida comienza a tomar un giro de los acontecimientos una vez más.
Tenía a "SHIKI" anunciado muerto (como el niño Nanaya adoptado) pero en realidad en secreto confinado, y Shiki enviado a vivir con los Arima (como Toono Shiki), porque ahora era "incapaz físicamente" para convertirse en el próximo jefe de la casa Toono; un encubrimiento perfecto. Mientras que la sangre Nanaya de Shiki está activa ("modo Nanaya"), recibe fuertes impulsos para "Matar", que pueden manifestarse no solo en asesinato, sino también en deseo sexual y destrucción.
En las rutas alternativas de la novela visual: "Lado lejano" rutas Shiki no se encuentra con Arcueid, y la historia profundiza en las conspiraciones y misterios que rodean a los residentes actuales de la Mansión Toono; Akiha, Hisui y Kohaku.
También vuelve a descubrir las técnicas y sentidos ocultos que había afilado cuando era niño. Por lo general, se desencadena por encuentros con lo sobrenatural, o cuando está en un aprieto. Con el tiempo, lentamente comienza a acostumbrarse a ello, y no se pierde tanto mentalmente. Tiene dolores de cabeza cuando usa sus Ojos Místicos de Percepción de la Muerte en exceso, ya que ponen una tensión en su cerebro. Si se mantiene empujando, puede dañar permanentemente su cerebro, y se le ha notificado de esto en muchas ocasiones.
Es conocido como Nanaya Shiki, y es el último del clan Nanaya de cazadores de demonios y sobrenaturales. Fue adoptado por Toono Makihisa (el padre de Akiha), después de haber liderado la masacre de los Nanaya, debido a que su primer nombre era similar a su propio hijo; "SHIKI".
Después del incidente de casi muerte que involucró a Shiki y "SHIKI" en el patio, Toono Makihisa manipuló los recuerdos de Shiki para hacerle olvidar la Nanaya y la existencia de "SHIKI", con la esperanza de que mantuviera la imagen de su hijo "Toono Shiki"; para mantener las apariencias.
Es conocido como Nanaya Shiki, y es el último del clan Nanaya de cazadores de demonios y sobrenaturales. Fue adoptado por Toono Makihisa (padre de Akiha), después de que su madre, Nanaya, se