Tomoya Okazaki es el protagonista masculino de Clannad. Debido a su hábito de llegar siempre tarde a la escuela, faltar a clases durante el día y permanecer fuera toda la noche, ha sido etiquetado como delincuente o como un joven que desafía la autoridad. Es amigo de la infancia de Kotomi Ichinose y es el mejor amigo de Youhei Sunohara. A medida que avanza en la escuela secundaria, se encuentra con muchos nuevos amigos, como Kyou, Ryou, Tomoyo, Fuko y, por supuesto, Nagisa. Tiene una habilidad especial para resolver los problemas de sus amigos, y parece que se preocupa por todos ellos profundamente. También parece ignorar que algunas de las chicas de la escuela muestran interés en él. La historia principal en Clannad es sobre Tomoya aprendiendo sobre el punto de tener familiares y amigos. También tiene contrapartes alternativas en la línea de tiempo que terminan con Tomoyo y Kyou respectivamente en el anime. Desde que su madre, Atsuko, murió en un accidente automovilístico cuando era joven, Tomoya ha estado viviendo con su padre, Naoyuki Okazaki, con quien discute constantemente. Tomoya resultó herido durante una pelea con su padre hace tres años; Desde entonces, su relación ha sido muy distante.
Tomoya se casa con Nagisa, donde pronto tienen un hijo, Ushio, pero al dar a luz, Nagisa muere poco después. habiendo sentido que ha perdido a Eve.
La historia principal de Clannad es sobre Tomoya aprendiendo sobre el sentido de tener familia y amigos. También tiene contrapartes de líneas de tiempo alternativas que terminan en el momento