Shuuichi Inaba es estudiante de una escuela secundaria especial para jóvenes prodigios y uno de los usuarios de la aplicación más nueva y popular llamada Alice en Cyberland, una aplicación con una IA que permite a sus usuarios hablar con ellos como con cualquier otro ser humano. Cuando algunos de los estudiantes de su escuela secundaria comienzan a ser atacados por un misterioso culpable, Shuuichi está decidido a descubrir quién es. En su investigación, se topa con Alice , un tipo especial de programa que, a cambio de ayudarlo con el caso, exige solo saber algo que generalmente nunca le diría a nadie: su secreto más grande y más profundo. (Fuente: MU)