En el futuro no muy lejano de 2032, la frontera que divide a los humanos y las máquinas ha sido cruzada. Los crímenes cometidos por cyborgs de carne y hueso son investigados por la Sección 9, un escuadrón antiterrorista de élite dirigido por el Jefe Aramaki y su asistente cyborg, el Mayor Motoko Kusanagi. La Sección 9 se ha enfrentado a innumerables adversarios en el mundo real y en el ciberespacio, pero ninguno como 'The Awakened'. Cuando la Mayor Kusanagi captura a una de las víctimas, ella hackea su cerebro cibernético para aprender la identidad del líder de la banda, lo que descubre la lleva en un viaje profundo al corazón del ciberespacio, un viaje que la sacude hasta el núcleo....................................