Kimi ni Nidome no Sayonara wo.  

A Second Goodbye to You., 君に二度目のさよならを。

Hinata Harusawa, que trabaja como diseñador web, recibe una llamada que dice que el cuerpo de su mejor amigo, Sora Otonashi, que desapareció en su segundo año de secundaria, ha sido encontrado. Asiste al velorio con otros miembros del club de arte al que pertenecía Sora en ese momento, el director Hase, el subdirector Tokiwa y el director mayor Shinohara.. Sin embargo, Shinohara es atrapado por alguien, y Hinata también es atacada. Resiste desesperadamente para proteger su pintura, pero Hinata gradualmente pierde el conocimiento. Cuando se despierta, se encuentra en "ese lugar" en "ese día" -!! ¿Cuál es la verdad detrás de la desaparición y muerte de su mejor amigo?!