Sólo ha pasado un mes desde que conoció a la varita mágica Ruby, pero la vida continúa para la joven Illyasviel von Einzbern, mientras continúa equilibrando las responsabilidades de una estudiante y una chica mágica. Un día de camino a la escuela, Illya y su amiga Miyu Edelfelt son convocados por Rin Toosaka, quien les dice que el pulso de la Tierra se ha vuelto loco después de recoger las cartas mágicas. Al día siguiente, Illyasviel es atacada por la misma mujer de negro, y Prisma Illya es incapaz de detener la increíble fuerza de su doppelgänger. Apenas logra repeler a su atacante, pero sigue desconcertada por la identidad de su gemelo sediento de sangre. La energía de la estrella se desvanece y se vuelve más fuerte. La energía de la estrella se desvanece y se vuelve más fuerte. ¿Quién es este nuevo enemigo, y cómo va a detener a alguien cuyo aspecto y poderes coinciden con los suyos?