Naota es un niño japonés normal de sexto grado, pero cuando su hermano mayor se va a Estados Unidos para jugar béisbol, su hermano deja atrás a su novia Mamimi , de 17 años. Mamimi está enviando señales mixtas y avances a Naota, y él no sabe qué hacer con ella. Pero para empeorar las cosas, el mundo de Naota está totalmente al revés cuando es atropellado por una mujer en una Vespa. Durante su primer encuentro, ella lo golpea en la cabeza con su guitarra, lo que hace que le salga un cuerno de la frente. Ella se llama a sí misma "Haruko" y su presencia cambia la vida de Naotas a una locura aún mayor. (Fuente: ANN)
FLCL es una adaptación del anime del mismo título. La serie fue publicada en inglés por Dark Horse Comics en un volumen general el 29 de mayo de 2012.