La historia tiene lugar en un futuro cercano, en un mundo nacido de la imaginación humana. Aparecen lo que los humanos llamarían fantasmas o monstruos, y se los conoce como "fantasmas". El personaje principal, Haruhiko Ichijou, está en primer año en la Academia Hosea junto con su estudiante de último año Mai Kawakami, que lucha contra fantasmas con la habilidad "Espíritu de los cinco elementos", Reina Izumi, que tiene la habilidad "Phantom Eater", e Koito Minase, que lucha contra fantasmas en soledad. Experimentan los altibajos de la vida en la escuela secundaria antes de que un determinado incidente los lleve a la verdad de este mundo. (Fuente: ANN)
Musaigen no Phantom World recibió una mención de honor en la categoría de novela del 4to Premio de Animación de Kioto en 2013.