Después de conquistar la galaxia, la humanidad ha alcanzado su ápice y ahora está en un declive constante. Los recursos del universo están disminuyendo, y alrededor de 500 mil millones de humanos comienzan a regresar a su hogar en la Tierra. Así comienza una guerra entre las diversas facciones de los humanos por el control del planeta. Finalmente, un gobierno autoritario conocido como la Sanción de Gaia impide la repoblación de la Tierra.Captain Herlock fue uno de los Ala Elite que fue encargado por la Sanción de Gaia para defender la Tierra. Su flota de barcos era imparable bajo su mando. Sin embargo, la Sanción Gaia permite que una élite diplomática inmigre a la Tierra, lo que enoja a Herlock. Se vuelve pícaro y dispara contra los diplomáticos y el resto de su flota. Decide liberar la materia oscura en el planeta para hacerla inhabitable, pero también se ve envuelto en ella, lo que lo inmortaliza. Han pasado cien años, y el legendario Captain Herlock todavía está en libertad, con solo la Arcadia bajo su control. La Sanción Gaia continúa con sus planes de control sobre la Tierra, mientras oculta su verdadero estado. ¡Pero Captain Herlock se está preparando para un enfrentamiento final con ellos, que determinará el destino del mundo!
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