Black Jack es el "Cirujano con las manos de Dios", un misterioso joven médico japonés que viaja por el mundo realizando hazañas de genio quirúrgico milagroso. Aunque todos reconocen su habilidad, Black Jack es ampliamente odiado, especialmente por el establecimiento médico, porque se niega a cumplir con las normas de cualquier tipo y porque cobra tarifas escandalosas por sus servicios. El único compañero de Black Jack es Pinoko, un niño que él creó a partir de un tipo especial de tumor llamado teratoma, que insiste en que ella es su esposa.