La historia tiene lugar después de que el 90 por ciento de la humanidad desapareciera debido a una invasión. Los sobrevivientes viven en un refugio donde se controla su vida y se borran los recuerdos de la invasión. Se elige a tres adolescentes del refugio para pilotar tres máquinas que se combinan para formar el robot Musashi, hecho de un material llamado aleación Megatronium. La serie equilibrará la acción del robot con la vida escolar.
Zuma from Nijiirozamurai (ずま(虹色侍))