Misaki, una mujer de 25 años que pronto se casará, encuentra una vieja foto tomada en la estación de Tokio y un viejo reloj de bolsillo roto de su difunto padre. Su padre trabajó en la estación de Tokio durante su vida y era un hombre muy estricto en su memoria, pero ella vio su sonrisa por la vieja foto que nunca había visto antes. Misaki, en un intento por reparar el viejo reloj de bolsillo, descubre que existía una tienda de relojes en la estación de Tokio en el pasado.
Toki wa Meguru fue creado para celebrar el centenario de la estación de Tokio. El objetivo del anime corto es mostrar la historia de la estación a través de la animación y la música.