Después de la muerte de sus padres, Yuuto Amakawa vive una vida bastante ordinaria en la ciudad. El único problema por el que tiene que preocuparse mientras asiste a la escuela junto con Rinko, su vecino de al lado, es su alergia a los gatos. Todo eso cambia en su decimosexto cumpleaños, cuando un Ayakashi, una criatura sobrenatural, lo ataca por los pecados de sus antepasados. Afortunadamente, es salvado por Himari, una misteriosa mujer gato con una espada, que explica que Yuuto es el vástago de una familia de asesinos de demonios, y ella está allí para protegerlo ahora que el hechizo que lo mantuvo oculto de lo sobrenatural las fuerzas del mundo han perdido su poder.Omamori Himari narra los tratos de Yuuto con las diversas fuerzas del mundo sobrenatural, así como con el creciente número de mujeres que aparecen en su puerta, cada una con sus propios deseos oscuros. ¿ Yuuto podrá adaptarse a su nuevo entorno "emocionante"? ¿O el fantasma de su pasado (ancestros) lo alcanzará?
Omamori Himari toma de los primeros cinco volúmenes de su material fuente con una desviación notable en el contenido y la trama, lo que lleva a un final exclusivo de anime.