1. Final Flight of the OsirisLa tripulación del Osiris descubre un ejército que se prepara para invadir Sión. Mientras un miembro de la tripulación corre dentro de Matrix para llevar el mensaje a Zion, los otros intentan desesperadamente ganarle suficiente tiempo mientras luchan contra una avalancha de Centinelas que posiblemente no pueden derrotar.2-3. The Second Renaissance Parte 1 y 2Los humanos han creado la IA definitiva, que es tan inteligente como ellos. Pero las complicaciones surgen cuando estos robots y los humanos intentan existir pacíficamente, y finalmente estalla una guerra total. Los humanos finalmente pierden la guerra y quedan atrapados en Matrix como se ve en las películas de acción en vivo.4. Kids StoryUn joven descubre que su mundo no es real, que es una tierra de fantasía generada por computadora creada por robots que usan humanos para obtener energía. Escapa con la ayuda del hacker Neo. Basado en la trilogía Matrix.5. ProgramCis e Duo participan en una batalla en una recreación virtual del Japón feudal.6. World RecordMientras corre la carrera más rápida de su vida, una estrella campeona de pista se libera de su mundo generado por computadora por un pequeño período de tiempo. Cuando regresa al mundo real, no tiene recuerdos y es colocado en un hogar de ancianos. Basado en la trilogía Matrix.7. Mientras busca a su mascota perdida, una joven se reúne con algunos niños en Tokio para jugar en una "casa embrujada", que es realmente una falla en su mundo informático. Basado en la trilogía Matrix.8. Detective StoryUn detective llamado Ash es llamado por una misteriosa organización para cazar al notorio hacker Trinity.9. MatriculatedUn grupo de científicos captura un robot y lo coloca en un mundo de fantasía surrealista. Cuando los amigos robots entran y matan a la mayoría de los científicos; Sin embargo, el robot y el último científico que queda se enfrentan al aislamiento en el mundo generado por computadora. Basado en la trilogía Matrix. (Fuente: ANN)
La película ganó el Premio Annie 2003 a la Mejor Producción de Entretenimiento Animado para el Hogar.
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