La película comienza con Fuyuki Hinata y Keroro Platoon explorando un templo abandonado en la ciudad de la montaña de Machu Picchu en Perú. Durante la exploración, Keroro dispara accidentalmente una trampa, y por casualidad encuentran una cámara oculta con un gran cristal azul en el centro, en un soporte que tiene una llave. Keroro se apoya en la llave, lo que hace que la habitación active una máquina misteriosa, lo que hace que todo el templo tiemble. Tan pronto como el grupo se dio cuenta de lo que estaba sucediendo, salieron corriendo de la habitación. Mientras corre, Keroro pierde accidentalmente su Kero Ball mientras Fuyuki capta un vistazo fugaz de una mujer joven y brillante mientras está corriendo, y le dice a Keroro que había una niña en la habitación, pero se ve obligado a abandonar la habitación antes de que pueda decir Algo más. El grupo escapa con éxito, mientras que la niña (ahora con un par de alas brillantes) los ve irse, mientras que de vuelta en la cámara, algo está creciendo dentro del cristal ... (Fuente: AniDB)