Rika Furude y su grupo de amigos viven en el pequeño pueblo de montaña de Hinamizawa; en June 1983, dan la bienvenida al estudiante transferido Keiichi Maebara en sus filas, convirtiéndolo en el único chico de su grupo. Después de la escuela, se divierten jugando juegos y pasando cada día viviendo sus vidas al máximo. A pesar de esta rutina aparentemente normal, Keiichi comienza a notar un comportamiento extraño de sus amigos, que parecen estar ocultándole los oscuros secretos de la ciudad. En otro lugar, una cierta persona observa estos eventos cada vez más inquietantes y recuerda todas las veces que esto y otras historias similares se han desarrollado. Usando ese conocimiento, esta persona decide arreglar estos mundos rotos. Sin embargo, cuando ciertas variables cambian, el individuo se enfrenta a una comprensión horrible: no tienen idea de qué esperar o cómo detener la tragedia inminente.